Package Descriptions for Ubuntu

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58955.
Privacy enhancing HTTP Proxy
 
Summary
Proxy HTTP améliorant l'anonymat
Translated by Michael Vogt
Located in Package: privoxy
58956.
Privoxy is a web proxy with advanced filtering capabilities for protecting privacy, filtering web page content, managing cookies, controlling access, and removing ads, banners, pop-ups and other obnoxious Internet junk. Privoxy has a very flexible configuration and can be customized to suit individual needs and tastes. Privoxy has application for both stand-alone systems and multi-user networks.
 
Description
Privoxy est proxy web doté de fonctions de filtrage avancées pour la protection de la vie privée, pour le contenu des pages web, de gestion des fichiers témoins (cookies), de contrôle des accès et de suppression des publicités, bannières, fenêtre intempestives et autres détritus inopportun d'Internet. Privoxy a une configuration très flexible et peut être personnalisé pour convenir à vos besoins et vos goûts. Privoxy est utile aussi bien aux systèmes autonomes (stand- alone) qu'aux réseaux de plusieurs utilisateurs.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: privoxy
58957.
Privoxy is based on Internet Junkbuster (tm).
 
Description
Privoxy est basé sur Internet Junkbuster (tm).
Translated by Michael Vogt
Located in Package: privoxy
58958.
Probabilistic multiple alignment program
 
Summary
logiciel d'alignements de multiples séquences probabilistes
Translated by Michael Vogt
Located in Package: proalign
58959.
ProAlign performs probabilistic sequence alignments using hidden Markov models (HMM). It includes a graphical interface (GUI) allowing to (i) perform alignments of nucleotide or amino-acid sequences, (ii) view the quality of solutions, (iii) filter the unreliable alignment regions and (iv) export alignments to other software.
 
Description
Le logiciel ProAlign réalise des alignements de séquences probabilistes en utilisant le modèle de Markov caché. Il inclut une interface graphique utilisateur permettant de: (i) réaliser des alignements de nucléotides ou d'acides aminés (ii) visionner la qualité des solutions (iii) filtrer les régions considérées non fiables de l'alignement (iv) exporter les alignements vers d'autres logiciels
Translated by Michael Vogt
Located in Package: proalign
58960.
ProAlign uses a progressive method, such that multiple alignment is created stepwise by performing pairwise alignments in the nodes of a guide tree. Sequences are described with vectors of character probabilities, and each pairwise alignment reconstructs the ancestral (parent) sequence by computing the probabilities of different characters according to an evolutionary model.
 
Description
Le logiciel ProAlign une méthode progressive, telle que l'alignement de multiples séquences est créé par étapes en réalisant des alignements par paires dans les noeuds d'un arbre de guidage . Les séquences sont décrites avec des vecteurs de probabilité de symboles, et chaque alignement par paires, reconstruit la séquence ancestrale (parente) en calculant les probabilités de différents symboles selon un modèle évolutif.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: proalign
58961.
multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
 
Summary
alignement de séquences multiples en utilisant les probabilités à postériori de la fonction de partition
Translated by Łukasz Zemczak
Located in Package: probalign
58962.
Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.
 
Description
(no translation yet)
Located in Package: probalign
58963.
PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment
 
Summary
alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
Translated by Michael Vogt
Located in Package: probcons
58964.
Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.
 
Description
Ceci est un outil pour la génération d'alignements de séquences multiples de protéines. En utilisant une combinaison de techniques d'alignements basées sur la modélisation probabiliste et la cohérence, le logiciel PROBCONS a atteint les meilleures précisions des méthodes d'alignement à ce jour. Sur la base de données d'alignements de test de performance BAliBASE («[nbsp]Benchmark ALIgnment dataBASE[nbsp]»), les alignements produits par le logiciel PROBCONS montrent une amélioration statistiquement significative sur les logiciels actuels, contenant une moyenne de plus de 7[nbsp]% de colonnes alignées correctement que celles du logiciel T-Coffee, plus de 11[nbsp]% de colonnes alignées correctement que celles du logiciel ClustalW, et plus de 11[nbsp]% de colonnes alignées que celles du logiciel Dialign.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: probcons
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Contributors to this translation: 4E4F, AUGUSTIN BRONDINO, Abdoulaye, Alban CLERGEOT, Alban V, Alexandre, Alexandre Croteau, Alexandre Franke, Anne017, Anthony Noël, Apophis666, Aquilon, ArnaultVandeveld, Arnold Couchard, Arthur Sauvage, Arzach, Ash26, Aurélien RIVIERE, Aurélien Ribeiro, Babey, Baptiste, Baptiste Fontaine, Benitron, Berenger Okei, Bernos Guillaume, Bertrand Croq, Beuss, Bi30, Blackestmajor, Bonsoir, Borni DHIFI, Bristow, Bruno, Bruno, Bruno Avet, Cajuteq, Carcasse, CedS, Christophe Eschbach, Citron28, Clarence Snickers, ClemZ, CoudCoud, Damien H, DarkVodKa, David ., David Futcher, David Nottin, David Racine, Eglantine Schmitt, Emmanuel Gil Peyrot, Enrico Rosina, Ersplus, Flo Rahl, Florent (LSc), Florian-delaroche, FreddyONe73, GIRONE Remi, Geoffrey, Glyca, Goshu, GuiMol, Guillaume, Gwab, Havok Novak, Indhi Rousseau, Ir0nsh007er, J&V Georges, Jean-Christophe, Jean-Marc, Jerod212, Joachim R., Jonas Rockenbauer, Jonathan Pasquier, Julien, Julien Henry, Julien Humbert, Julien Rouvier, JurisZombie, Kafi, Kolibry, Ktux, Laurent N, Laurent Thibaud, Le Bourhis Mikaël, Lentdormi, Lola Farret, Louis Dubois, Louis Moureaux, Lucas Bayol, Maeda, Marot Célestin, Mathieu Disy, Max, Maxence BOTHOREL, Maxim Lopez, Michael Vogt, MilkaJinka, Moneron Xavier, Morgan, NSV, NaSH, Nguyen Jérémy, Nicolas Delvaux, Nicolas Robin, Nissar Chababy, OUBRAIM Rachid, Olivier, Olivier Copetto, Olivier FAYOLLE, Olivier Febwin, Olivier Vopat, OlivierT, PEIGNOT Kévin, Paer, Paquelier Alain, Pascal Maugendre, Paul Forget, Paulvirtuel, Philip Millan, Philippe, Pier-Luc Ducharme, Pierre Scacchi, Pierre Slamich, Pierre-Alexandre Racine, Pierre-Alexis, Pierrick Vandenbroucke, Pique, Plank, Quentin Dorveaux, Quentin Santander, Ralphi2811, Remiweb, Removed by request, Robin Dumont-Chaponet, Romain, Romain DEJEAN, Roms, Rémi Berthoz, Rémi Larrouquis, Salvato-Vallverdu, SarahSlean, Seb24, Serge Pilon, Simon, Simon THOBY, St3ph, Stanislas Michalak, Steve Langasek, Stéphane Maniaci, Stéphane V, Sydney, Sylvhem, Sylvie Gallet, Tarek, Teo Tedoldi, Teromene, Thibault Févry, Thomas, Thomas Quaglio, Thomas.M, Titanet, Toxxic Zad, Tubuntu, Valentin Lorentz, William, Xavier, YannUbuntu, Yayel, Yohann, Youcef PhnixLord, Yvan Arnaud, Yvance77, _Syzygy_, afro luffy, antoine, arkan, axelle oxford, baj, bameylan, blackorpheus, bloch, bpascal123, calvin, clappier, clement62910, cocof35, constantin, didier Belot, dom, dpl29, electroluth, elyr, enebre, fabkzo, flobe, fredb59, fredurb1, gerard, gfds, gisele perreault, grosvalpin, hamelin, hucste, idon'thaveaname, jdt37b, jean-bernard marcon, jlla, jplemoine, judejude, kidpaddle, kleiber, kura, lann, ldmpub, le_youki, lebendre, ljere, londumas, louis1806, mart3300, michel_95, moberch, mothsArt, oswald_volant, parislanuit, pythaboc, royto, samuel poette, seb35690, shunesburg69, slurbe, stagelll, sylvain, thenasa, tiritchi, titouan le folgoc, vmerlet, vovd, yasmine, yeassay, ymadec, yohann, Łukasz Zemczak.