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200.

English:

Here the recursive parallelism paradigm is applied to the linear space profile-profile alignment algorithm. This approach is more time efficient on computers with distributed memory architecture. Traditional approach that relies on precomputing the profile-profile score matrix has also been implemented. Results shown the latter is indeed more appropriate for shared memory multiprocessor computer.

Description

Current French:

Ici le paradigme parallélisme récursif est appliqué à l'algorithme d'alignement espace linéaire profil-profil. Cette approche est plus efficace en temps sur les ordinateurs avec architecture à mémoire distribuée. L'approche traditionnelle qui repose sur des précalculs de la matrice score du profil-profil a également été mise en oeuvre. Les résultats ont montré que cette dernière est en effet plus appropriée pour les ordinateurs à processeurs à mémoire partagée.

Translated by Pierre Slamich on 2012-09-22

Reviewed by gisele perreault on 2012-09-25

Located in Package: clustalw-mpi

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