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355.
This program searches for and removes remnant adapter sequences from High- Throughput Sequencing (HTS) data and (optionally) trims low quality bases from the 3' end of reads following adapter removal. AdapterRemoval can analyze both single end and paired end data, and can be used to merge overlapping paired-ended reads into (longer) consensus sequences. Additionally, the AdapterRemoval may be used to recover a consensus adapter sequence for paired-ended data, for which this information is not available.
 
Description
Ce programme recherche et supprime des vestiges de séquences d'adaptateur de données HTS («[nbsp]High Throughput Sequencing[nbsp]») et découpe (optionnellement) les bases de mauvaise qualité des extrémités[nbsp]3' des lectures suivant la suppression de l'adaptateur. AdapterRemoval peut analyser à la fois des données «[nbsp]single end[nbsp]» et «[nbsp]paired end[nbsp]» et peut servir à fusionner des lectures «[nbsp]paired end[nbsp]» se chevauchant en des séquences de consensus (plus longues). De plus, AdapterRemoval peut servir à récupérer une séquence d'adaptateur de consensus pour les données «[nbsp]paired end[nbsp]» pour lesquelles cette information n'est pas disponible.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: adapterremoval-examples Package: adapterremoval
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