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Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosme), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.
 
Description
Tabix indexe des fichiers oú certaines colonnes indiquent les coordonnées de séquence[nbsp]: nom (habituellement un chromosome), démarrer et arrêter. Le fichier de données d'entrée doit être trié en fonction du positionement et compressé par bgzip (fourni dans cet paquet), qui a une inteface similaire à celle de gzip. Après indexation, tabix est en mesure de récupérer rapidement les lignes de données par coordonnées chromosomiques. La récupération rapide des données fonctionne aussi sur le réseau si une URI est donnée comme nom de fichier.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: tabix
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