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71308.
Unlike some earlier generation search engines, all of the X! Series search engines calculate statistical confidence (expectation values) for all of the individual spectrum-to-sequence assignments. They also reassemble all of the peptide assignments in a data set onto the known protein sequences and assign the statistical confidence that this assembly and alignment is non-random. The formula for which can be found here. Therefore, separate assembly and statistical analysis software, e.g. PeptideProphet and ProteinProphet, do not need to be used.
 
Description
Au contraire de quelques moteurs de recherche de générations précédentes, tous les moteurs des séries X! calculent la fiabilité statistique (valeurs espérées) pour toutes les affectations spectre-vers-séquence particulières. Ils réassemblent toutes les affectations de peptide dans un ensemble de données sur les séquences de protéine connues et affecte la fiabilité statistique de non aléatoirité de cet assemblage et alignement. La formule pour cela est disponible sur https://www.thegpm.org/docs/peptide_protein_expect.pdf. Par conséquent des logiciels d’assemblage et d’analyse statistique distincts, par exemple, PeptideProphet et ProteinProphet, n’ont pas besoin d’être utilisés.
Translated by Łukasz Zemczak
Located in Package: tandem-mass
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