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The current version of R/qtl includes facilities for estimating genetic maps, identifying genotyping errors, and performing single-QTL genome scans and two-QTL, two-dimensional genome scans, by interval mapping (with the EM algorithm), Haley-Knott regression, and multiple imputation. All of this may be done in the presence of covariates (such as sex, age or treatment). One may also fit higher-order QTL models by multiple imputation.
Description
La version actuelle de R/qtl inclut des structures pour estimer les cartes génétiques, identifier les erreurs du génotype, lancer des recherches de QTL simple et QTL double, des recherches bi-dimensionnelles, par correspondance d’intervalle (avec l’algorithme EM), la régression de Haley-Knott, et l’imputation multiple. Tout cela peut être réalisé en la présence de covariantes (comme le sexe, l’âge ou le traitement). Il est aussi possible de faire correspondre des modèles de QTL d’ordre plus élevé par imputation multiple.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: r-cran-qtl
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