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202.
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The original ClustalW/ClustalX can be found at URL: http://www.clustal.org/download/pre-2/
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Description
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Le programme ClustalW/ClustalX original peut être trouvé à l'adresse: http://www.clustal.org/download/pre-2/
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Translated and reviewed by
Pierre Slamich
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Located in
Package: clustalw-mpi
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203.
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Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)
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Summary
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alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
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Translated by
Michael Vogt
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Located in
Package: clustalx
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204.
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This package offers a GUI interface for the Clustal multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.
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Description
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Ce paquet offre une interface graphique utilisateur pour le programme Clustal d'alignement de plusieurs séquences. Il fournit un environnement intégré pour effectuer plusieurs alignements par séquence et par profil pour analyser les résultats. L'alignement de séquences est affiché dans une fenêtre sur l'écran. Un système de coloration souple a été intégré pour mettre en évidence les caractéristiques conservées dans l'alignement. Pour les présentations professionnelles, il convient d'utiliser le paquet texshade (LaTeX) ou boxshade .
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Translated by
Michael Vogt
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Located in
Package: clustalx
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205.
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The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.
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Description
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Les menus déroulants en haut de la fenêtre permettent de sélectionner toutes les options nécessaires pour les traditionnels alignements par séquences multiples et par profil. Vous pouvez couper-coller les séquences pour changer l'ordre de l'alignement[nbsp]; vous pouvez sélectionner un sous-ensemble de séquences à aligner[nbsp]; vous pouvez sélectionner une sous-plage de l'alignement à réaligner et réinsérer dans l'alignement original.
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Translated by
Michael Vogt
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Located in
Package: clustalx
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206.
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An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.
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Description
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Une analyse de la qualité de l'alignement peut être réalisée et les segments à faible score ou les résidus exceptionnels peuvent être mis en évidence.
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Translated by
Michael Vogt
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Located in
Package: clustalx
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207.
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Reimplementation of the Eisen-clustering software
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Summary
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Réimplémentation du logiciel de clustering Eisen
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Translated and reviewed by
Pierre Slamich
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Located in
Package: cluster3
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208.
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The open source clustering software available here contains clustering routines that can be used to analyze gene expression data. Routines for hierarchical (pairwise simple, complete, average, and centroid linkage) clustering, k-means and k-medians clustering, and 2D self-organizing maps are included. The routines are available in the form of a C clustering library, an extension module to Python, a module to Perl, as well as an enhanced version of Cluster, which was originally developed by Michael Eisen of Berkeley Lab. The C clustering library and the associated extension module for Python was released under the Python license. The Perl module was released under the Artistic License. Cluster 3.0 is covered by the original Cluster/TreeView license.
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Description
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Le logiciel Open Source, disponible ici regroupe des routines de regroupement pouvant être utilisées pour l'analyse de données d'expression de gènes. Les routines pour les regroupements hiérarchiques (liaison par simple paire, complète, moyenne et barycentrique), les regroupement par k-moyenne et k-médiane, et les cartes 2D des cartes auto-organisées sont incluses. Les routines sont disponibles sous la forme d'une bibliothèque en langage C de regroupement, un module d'extension en langage Python, un module en langage Perl, ainsi que d'une version améliorée d'un module de regroupement initialement développé par Michael Eisen, du Laboratoire de Berkeley. La bibliothèque de regroupement en langage C et le module d'extension associé en langage Python ont été publiés sous la licence Python. Le module Perl a été publié sous la licence artistique. Le module de regroupement 3.0 est couvert par la licence originale Cluster / TreeView.
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Translated and reviewed by
Pierre Slamich
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Located in
Package: cluster3
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209.
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This package only contains the command line and motif gui versions of Cluster 3.0.
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Description
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Ce paquet contient uniquement les versions de Cluster 3.0 en ligne de commande et en interface graphique motif.
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Translated by
Pierre Slamich
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Reviewed by
gisele perreault
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Located in
Package: cluster3
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210.
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highly configurable system monitor (all features enabled - debug)
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Summary
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moniteur système hautement configurable (toutes les fonctions sont activées - débogage)
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Translated by
Pier-Luc Ducharme
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Reviewed by
Anne017
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Located in
Package: conky-all-dbg
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211.
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Conky is a system monitor that can display just about anything, either on your root desktop or in its own window. Conky has many built-in objects, as well as the ability to execute external programs or scripts (either external or through built-in lua support).
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Description
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Conky est un moniteur système qui permet d'afficher n'importe quoi, que ce soit sur votre bureau root ou dans sa propre fenêtre. Conky dispose de nombreux objets intégrés, ainsi que de la possibilité d'exécuter des programmes ou des scripts externes (externe ou via la prise en charge de lua intégrée).
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Translated by
Pierre Slamich
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Reviewed by
Pierre Slamich
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Located in
Package: conky-all-dbg
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