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This package takes a list of p-values resulting from the simultaneous testing of many hypotheses and estimates their q-values. The q-value of a test measures the proportion of false positives incurred (called the false discovery rate) when that particular test is called significant. Various plots are automatically generated, allowing one to make sensible significance cut-offs. Several mathematical results have recently been shown on the conservative accuracy of the estimated q-values from this software. The software can be applied to problems in genomics, brain imaging, astrophysics, and data mining.
Description
Ce paquet prend une liste de valeurs-p résultant du test simultané de plusieurs hypothèses et calcule leurs valeurs-q. La valeur-q d’un test mesure la proportion de faux positifs (appelé false discovery rate —[nbsp]taux de fausses découvertes) occasionnée quand un test particulier est dit significatif. Divers tracés sont automatiquement générés, permettant de dégager des niveaux de seuil pertinents. Plusieurs résultats mathématiques ont récemment montré la précision conservative des valeurs-q estimées à partir de ce logiciel. Ce logiciel peut être utilisé pour des problèmes de génomique, d’imagerie cérébrale, d’astrophysique ou d’exploration de données.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: r-bioc-qvalue
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