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16503 of 82199 results
16503.
HHsearch takes as input a multiple sequence alignment (MSA) or profile HMM and searches a database of HMMs (e.g. PDB, Pfam, or InterPro) for homologous proteins. HHsearch is often used for protein structure prediction to detect homologous templates and to build highly accurate query-template pairwise alignments for homology modeling.
Description
HHsearch prend en entrée un alignement de plusieurs séquences (MSA) ou de HMM de profil et recherche dans une base de données d’HMM (par exemple, PDB, Pfam ou InterPro) pour des protéines homologues. HHsearch est souvent utilisé pour la prédiction de structure de protéines pour détecter des modèles homologues et pour construire des alignements par paire précis de modèle de requête pour la modélisation d’homologie.
Translated by Michael Vogt
Located in Package: hhsuite
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